Simple et rapide, le génotypage, une technique pour gagner en efficacité !
Lancement du service
En 2016, le service d’indexation génomique a ouvert ses portes à la race Tarine. Technique connue et éprouvée depuis plusieurs années dans les autres races laitières, elle est aujourd’hui mondialement connue, fiabilisée et surtout utilisée ! Ouvrant de grandes perspectives pour les élevages, le génotypage permet de sélectionner plus rapidement et plus précisément les femelles à élever.
Pour l’éleveur, connaitre précocement la valeur génétique de se femelles c’est anticiper leur potentiel :
- Pour décider de les élever ou non
- Pour orienter son troupeau en fonction de ses objectifs plus facilement
- Pour réaliser des accouplements plus pertinents
Rétrospective des 4 dernières années :
Depuis son lancement, plus de 4605 femelles ont été génotypées par les éleveurs. En race Tarine, le nombre d’animaux génotypés a beaucoup progressé entre 2016 et 2017 et entre 2017 et 2018 (cf graphique ci-dessous). Le nombre de génotypage se stabilise entre 900 et 950 sur 2018-2019 et 2020.

Nous avons rapidement profité des améliorations faites dans les grandes races laitières concernant le suivi et l’optimisation du laboratoire de typage. En effet, après des délais longs de typage, on note en 2020 de réelles avancées et un délai entre son arrivée au laboratoire et le typage de l’échantillon de seulement 20 jours. En 2020, plus de 305 000 échantillons ont été traités par VALOGENE soit plus de 1000 échantillons par jour ; un nombre conséquent entraînant parfois des délais plus longs de rendu auprès de l’éleveur.

L’intérêt de la démarche est de génotyper les femelles avant leur première mise à la reproduction pour évaluer tout leur potentiel Il est également possible de génotyper les vaches, mais généralement les éleveurs savent déterminer après une première lactation si les femelles performeront dans leur élevage ou non. En race Tarine, l’âge moyen des femelles génotypées est de 5 mois (cf graphique ci-dessus).
Il est possible de génotyper ses femelles tout au long de l’année, en revanche, dans nos races de montagne, la période d’alpage n’est pas la plus propice pour prélever les femelles. Les mois les plus chargés en prélèvements sont : décembre, janvier et avril juste avant la mise à l’herbe (cf graphique ci-dessous).

Des stratégies à mettre en place
Pour optimiser l’outil, il faut analyser précisément les résultats pour approfondir l’évolution du troupeau et observer les générations à venir en fonction des objectifs de l’éleveur. Depuis que ce service est ouvert, CAP TARENTAISE, en partenariat avec EDS et AURIVA vous propose de suivre ces résultats et de vous accompagner à mettre une stratégie troupeau en place.
En soit un résultat d’indexation génomique n’est utile qu’à un instant T. Il est en effet important d’appréhender le troupeau ou le lot dans sa globalité :
- Quel sera le potentiel des générations à venir ?
- Quels choix stratégiques dois-je prendre ?
- Comment choisir mes femelles pour le renouvellement ?
Cette étape de tri, de mise en place de la conduite des génisses est primordiale pour gagner en efficience et les techniciens de race peuvent vous y aider. En amont du planning, ils peuvent vous conseiller sur votre troupeau et vous accompagner sur le choix des femelles à travailler en fonction de vos objectifs afin d’optimiser les accouplements.
Résolument tournés vers l’avenir et les orientations génétiques à donner, nous avons analysé les résultats des futures productrices et leur potentiel à venir. Vous observerez dans le tableau ci-dessous les moyennes des femelles génotypées par critère : Production, Morphologie et Fonctionnels (par année de naissance). On note ainsi une nette amélioration des taux (TP et TB) pour les femelles nées en 2019 et 2020 et une belle amélioration également des niveaux de la synthèse Mamelle et Trayons. Nous devons tout de même rester vigilants sur la musculature et sur les index fonctionnels.

Tableau des indexs étudiés
L’âge moyen en 1er lactation en race Tarine est de 36 mois, les femelles nées en 2018 sont en cours de production. Sur les 900 génotypées, leur niveau moyen laitier est en progression par rapport à 2017 avec une bonne amélioration des qualités du lait notamment en TB. Ces critères de production ont été les premiers critères d’amélioration lors de l’arrivée de la sélection génomique et surveillés dans le choix des jeunes taureaux. On devrait voir apparaitre des animaux à la conformation optimisée et avec une bonne mamelle dans les années à venir.
Véritable facteur d’amélioration, le génotypage femelle est un investissement de long terme. Une fois la femelle génotypée, il faudra attendre 3 ans avant de connaitre ses performances et il faudra encore quelques années pour voir l’impact de la mise en place de la stratégie de renouvellement. En revanche, même si cela semble long, travailler avec des index génomiques est toujours plus fiable qu’avec des index ascendances et génotyper vous permettra d’optimiser cette stratégie dès le premier accouplement.